Сериал «Цитадель», сочетающий элементы боевика, триллера и драмы, начинается с трагической предыстории одноименного шпионского агенства, стоящего на страже независимости и безопасности людей по всему миру. За восемь лет до событий основного сюжета организация была уничтожена оперативниками из подпольного синдиката «Мантикора», которые убили всех, кого могли, а чудом выжившим мужчине и женщине стерли память с помощью специальной технологии.
Бывшим элитным агентам, Мейсону Кейну и Наде Шинь необходимо вспомнить свое прошлое, чтобы объединиться и подорвать власть возвысившейся криминальной группировки, намеренной полностью нарушить миропорядок ради собственной выгоды.
Отправной точкой сюжетного действия становится встреча Мэнсона с бывшим коллегой по секретной службе, Бернардом Орликом, который разыскивал Кейна долгие годы. Узнав правду о произошедшем много лет назад, мужчина находит напарницу, так же ни о чем не подозревающую после разгрома «Цитадели» восьмилетней давности. Вместе они готовы дать отпор «Мантикоре».